Naruto.Online: Het verhaal

Twaalf jaar leden verscheen de Kyuubi (een vos met negen staarten). Een staartzwiep kon met gemak een hele berg verwoesten of een tsunamie veroorzaken. Om terug te vechten verzamelden de mensen ninja's. De leider van de Hidden Leaf Village, de Fourth Hokage, versloeg het monster door zijn eigen leven op te offeren en het monster weg te stoppen in het lichaam van een net geboren jongetje, dit is Uzumaki Naruto.

Naruto hoopt dat hij later ook ooit Hokage kan worden. De meeste mensen in het dorp hebben een hekel aan Naruto, omdat ze hem zien als de Kyuubi. Omdat niemand Naruto mag, groeit hij op zonder familie en vrienden en is hij erg eenzaam. Om toch enige aandacht te krijgen maakt hij misplaatste grappen en haalt hij kattenkwaad uit.

Dat veranderd snel als Naruto afstudeerd van de Ninja Academy. Dit door zijn Kage Bunshin no Jutsu te gebruiken, om zijn leraar, Umino Iruka, te redden van de slechte ninja Mizuki. Op deze dag leert Naruto twee dingen, één dat Kyuubi in hem opgesloten zit, en twee dat er toch iemand was die om hem geeft (namelijk zijn leraar Iruka). Deze vroege gebeurtenissen leiden tot de verdere gebeurtenissen uit de manga/anime.